销售门窗和安装服务需要分开核税。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第四十条规定，销售门窗享受增值税办法征收增值税普通零税率，安装服务应税体现在增值税发票上，应按照税率核算纳税。拓展知识：增值税发票是纳税人凭证，税控系统依据增值税发票数据完成自动报税，所以建议纳税人在开票时，务必正确归类，商品明细应当全部列明，发票项目应与实际支付的费用相符，必要时应当进行分开录入，以便税务机关核实。