企业购买甲材料一批，价款为40000元，增值税为5200元，价税款均以银行存款支付。首先，企业应向税务机关申报增值税，并认真填写申报表，并准确填写应纳税额。其次，完成增值税的申报后，企业应缴纳增值税，价税款以银行存款支付是比较常见的支付方式。最后，材料已经验收入库，企业应确认验收单并进行财务初步登记，并将整个交易过程记录在财务会计凭证中。拓展知识：在企业购买材料的过程中，不仅仅需要正确处理价税款，还要明确购买时对供应商的文件和合同，以及收货单据和验收单据，方便以后查询、核算和税务处理。