发票抵扣联丢失，需要到税局备案，是一定要备案的。如果不备案，会对抵扣有影响，因为该申请备案的发票抵扣联是企业申请个税减免必须提供的证明材料，该证明材料被企业提交给税务机关进行登记，核定登记后方可申请减免个人所得税。如果不备案，就不能申请个人所得税减免，也就无法实现抵扣的目的了。因此，建议您尽快到当地税务机关备案该发票抵扣联，以免耽误抵扣的正常进行。 拓展知识：发票抵扣联包括发票抵扣联一式三份，分别用于纳税人存档、地税机关备案以及抵扣税款费用等。发票抵扣联在纳税人登记注册时由税务机关发放，税务机关每半年审核一次发票抵扣联，以确保抵扣联的真实有效性。