发生这种情况时，首先应该搜集证据，确认是否有实际支付工资的情况。如果有的话，应该及时采取补税措施，补充缴纳应缴纳的个人所得税，同时从源头阻断偷漏税款。首先，公司应查询账户内实际发放工资的情况，确认要补缴的个人所得税金额及其征税范围，再按照相关税收法规的规定，提交申报表，填报未缴税的时期，缴纳应补税的个人所得税。此外，年底前还可在税务机关网站上主动申报税款，补缴税款可获得免税待遇。在确保正确填报的情况下，对未缴税款可以减少与实际有关的补充缴税金额，以及合理申请单位和个人税收减免情况。 拓展知识：根据《中华人民共和国税收法》规定，单位向员工发放的工资应按照有关规定缴纳个人所得税，补充缴税也应遵守《中华人民共和国税收法》。此外，根据《税收征管法》规定，单位应支付薪酬或发放利润等收入时，应当缴纳个人所得税。具体的税收缴纳流程可以参照国家的税收法规解释。