电子普通发票作废的操作流程如下： 1.登录发票管理软件，点击“开具发票”-“作废发票”； 2.选择发票在系统中的开具类型，根据发票代码，号码和金额确定要作废的发票； 3.点击“作废”按钮，进行发票选择，确定后输入作废原因，进行确定操作； 4.发票作废完成，此时发票被标记为“作废”状态（在发票管理软件上可以看到已作废的发票）。 加上拓展知识：一般来说，作废的发票不能使用，但实际情况可能有所不同，如果发票作废后由发票管理方完成更改，有可能改变发票状态，恢复原来的发票状态，此时发票又可以使用了。