车船税直接支付的电子保单没有发票。根据财政部的相关规定，车船税的缴纳方式有三种，现金支付、支票支付和直接电子支付，其中现金支付和支票支付时，可以发放发票；但是对于直接电子支付缴纳车船税，由于涉及到多个跨部门的数据交换，发票不能够发放。但是在此过程中，相关缴纳者可以获得一份电子保单，用以证明自己缴纳了车船税，可以作为一种参考证明。 从上述可以看出，电子直接缴纳车船税没有发票，但是可以凭借电子保单作为一种参考凭证。这不仅降低了车船税的缴纳成本，也大大提升了缴税效率，为企业减轻了财务负担。同时，也为相关机构提供了一种多维度的信息数据采集、管理机制，更好的推进企业信息化工作。