在村集体经济联合社中用原来收到的补助收入支付工程款的账务处理应包括以下几个步骤： 一、定期查验补助收入情况。要按照有关要求定期查验补助收入的来源、数量、领用期限等情况，并将查验结果记录在案。 二、使用补助收入支付工程款时，应严格按照财政部门核定的用途使用，并将使用数额和使用时间及情况，记入日记账。 三、财务核算，补助收入支出结果应向财政部门进行备案，保证其收入使用合规。 四、工程款使用完毕后，应及时进行项目结算，并按时进行财务核算及备案，以便财政部门查验收入使用情况。 拓展知识：村集体经济联合社的账务处理还应确立发票入账通知及费用补录通知，定期对村集体经济联合社的账务情况进行监督检查，并按规定上交财务报表，以确保联合社账务处理的真实性和合法性。