要修改自然人电子税务局扣缴端申报累计的金额，需要登录税务机关网站进行操作。首先，登录外网电子税务局网站，在网站首页右上角点击“登录”，输入自然人识别号、登录密码和手机短信验证码，登录税务网站。然后在自然人税收管理主页点击“申报服务”，找到“自然人扣缴义务申报”，点击进入。在页面中，可以查询到“本期应缴纳的税款”，可以根据实际情况修改，点击“保存”即可保存信息。 此外，自然人在申报累计金额时，应该特别注意，申报的金额数额应该与实际应缴纳金额一致，否则会被税务机关查出，可能会面临相应的处罚。