关于报关单上的海运费和实际支付收到发票的海运费有差额，这个差额的处理要看实际情况，是发生在时间上的还是金额上的。如果是发生在时间上，则在报关结账的时候，应将此时的海运费收取成实。如果是发生在金额上，则应将差额登记到入库成本中，以便作为成本的一部分结算。 另外，也可以将海运费的差额收入其他费用中作为无形资产进行折旧，以降低成本、提高利润。同时，要督促管理部门不断优化流程，压缩成本，提高企业财务效率。拓展知识：另外，海运费的核算不仅要符合国家认可的会计准则，还应符合企业内部实施核算，避免漏掉可以抵扣的费用。