您好，根据《个人所得税法》的规定，自然人代开发票的情况下，您的公司有责任协助自然人申报个人所得税。根据《个人所得税法实施条例》第16条规定，购买方报销人员应当协助自然人申报个人所得税，即将购买方申报个人所得税所需要的个人所得税信息提供给自然人，且应当对自然人的申报信息和纳税行为负责。所以，您的公司有义务协助自然人申报个人所得税，并且要对自然人的申报信息和纳税行为负责，并且要负责代扣代缴个人所得税。 此外，购买方报销人员还应当协助自然人了解有关个人所得税实施条例，及时告知自然人有关个人所得税收支等情况，以便自然人能够准确申报个人所得税。