要查询公司开出的专票客户是否有抵扣，可以通过国家税务局的网站来查询，步骤如下： 1、进入国家税务局的网站，如果还没有账号，需要先进行申请； 2、登录后进入专票查询页面，输入企业信息和专票号； 3、查询结果中会显示该企业的开出的专票是否有抵扣； 拓展知识：专票是国家税务部门专为增值税纳税人准备的发票，它可以作为纳税人作为纳税证明，具有专票号，可以申请增值税抵扣，还可以在发生税务纠纷时提供证明。