在公司申报个税时，住房公积金和补充住房公积金都应填写在“个人公积金”部分。住房公积金是一种通过实行职工住房储蓄制度，由参加单位和参加个人共同缴纳的一种储蓄性社会保险制度。补充公积金的缴费，是由职工参加单位提供的一种非货币性的福利，供职工购买商品房、住房首付款等，也可以用来还贷或存入住房公积金个人账户。 关于住房公积金，是指参加单位与参加个人共同缴纳的职工住房储蓄制度，通过住房公积金实现职工住房改善，改变职工生活状况，为参加单位提供经济支持，社会提供减轻住房压力的服务。 此外，住房公积金和补充住房公积金也有一定的税务优惠，可以在个人所得税的“个人公积金”部分申报减免，减免范围受到限制，每年减免不能超过50%的税前工资收入，也就是说，每年最多可以减免6000元的个人所得税。