银行收到小规模二季度代开增值税作废专票的退税款做账的具体流程是： 1、银行按照退税凭证对收到的代开增值税专用发票登记情况，应当建立记录。 2、银行需要将收到的退税款明细审核，确认后作账。管理员应当根据增值税专用发票在系统中进行审核，并确认此笔费用是增值税专用发票作废所对应的退税款。 3、银行应当在账户中登记收到的代开增值税作废专票的退税款，并在这一笔收入上记入应收税款明细。可以将收到的退税款归类为应交税款下的外部收入，编制相应凭证。 4、进行税务有关账务登记。应将收到的退税款明细记入税务有关账册，在相应科目下登记好，并进行计算和核算。 拓展知识： 做账时，银行要加强对收到的代开增值税专用发票的退税款的实物核实，以及专票的真实性等，从而防止因实物等原因造成的款项丢失而致使税款被拖欠。