在公司购买新能源汽车的情况下，增值税抵扣按照实际支付的金额来计算，即按照20万元的金额计算增值税抵扣额。这样的计算原则是因为增值税抵扣政策是以实际支付金额为准，增值税抵扣全要在实际支付额度内完成。这里，实际支付金额指的是经过国家补贴后的金额，也就是20万元。 拓展知识：增值税抵扣是指，在购买物品或服务时，纳税人可以在申报纳税时从应纳税额上扣除出税价支付的税款，从而减少纳税义务人的税负。增值税抵扣的税负额上限为纳税人实际支付的税额，不得超出。