小规模纳税人开支25万元的工程资料款可以免征增值税。根据《增值税政策性法规》第六十五条规定，对于小规模纳税人开支25万元以下的工程资料款，可以不征收营业税。同时，免征营业税的工程资料款不得与其他增值税项目混合抵扣，也不能将其用于增值税适用的供应和销售。 此外，小规模纳税人开支25万元以上的工程资料款，也可以适用中小企业工税抵扣，即将工程资料款作为费用成本，在销售收入中抵扣，从而实现增值税减让。 这也说明，正当纳税人履行义务，充分利用小规模纳税人免税政策优惠，可以在合规方面更加节省成本，增加企业的净利润。