运输行业发放工资计入应付职工薪酬科目。具体来说，根据《中华人民共和国会计准则（第四版）》的指引，运输行业发放的工资应分别计入支付职工薪酬-本期支付的职工薪酬和应付职工薪酬-工资福利费等固定科目中。 除此之外，在运输行业用于发放给职工的费用，例如医疗保险，养老保险，失业保险，公积金等，也应计入应付职工薪酬科目中。 拓展知识：根据《中华人民共和国会计准则（第四版）》规定，应付职工薪酬科目应包括工资、奖金、津贴、补贴、住房公积金、医疗保险、失业保险、工伤保险、养老保险等费用。