按照中国税收法规，厨师9月份的个税应该在11月扣除。因为厨师9月4号入职，没有超过一个月，应该在11月份时扣除其9月份工资的个税。在11月，需要把厨师入职之后9月份工资的所得额及个人所得税额作纳税申报，交纳税款。税收部门根据申报人提供的纳税信息对其工资实行税收征管，进行个人所得税，实行按月或按季收税。拓展知识：税法律规定，个人应按月应纳税额不超过当月实际应付工资收入额的12%，月应纳税额不低于当月应付工资收入额的200元。