是，医药公司可以开一张核酸检测补助费用的发票。根据《国家税务总局关于印发〈企业支付个人补助费用发票管理办法〉的通知》，企业可以为个人支付的医疗费用、住宿费、职工福利费、其他个人补助费用均可以开具发票。核酸检测补助费用可以视为企业为个人支付的其他个人补助费用，所以可以开具核酸检测补助费用发票。 另外，除了具备发票开具条件外，医药公司还需要遵守《国家税务总局关于发票管理有关问题的公告》（国家税务总局公告2020年第72号）的要求，按照该公告的要求，医药公司应当按照发票管理有关要求严格执行发票管理制度，以确保发票管理规范，确保发票流转准确、安全，防止发票泄露。