应该使用分录来记录此交易。首先，在银行账户中分录收入，记为银行账户收入，并将金额标记为实际转账金额减去手续费；接着，在手续费支出账户中分录手续费支出，支出金额为实际手续费，但此处要根据实际情况，如果公司承担手续费的话则金额为0；最后，根据公司政策，在固定资产账户中分录手续费抵免，并对抵免款项进行记录和追究。 以上就是如何分录由客户通过刷信用卡付款到公司账户，公司承担手续费的情况。其实，在工作中，不管是由客户付款还是公司付款都要细心按照财务准则分录，以免弄错记录。另外，有些情形我们可以考虑使用自动分录规则，减少人力成本，提高分录效率。