在这种情况下，店长应该撤销发出的6300元发票，以5300元为依据重新开具发票，并在发票上标注“应交税费负担”。然后，按照5300元的发票完成维修工作，并将5300元全额付给该发票的发票抬头方。最后，按照正常报销流程，将5300元发票正式报销。 拓展知识：报销流程中，报账金额必须与发票金额一致。当发票金额与实际费用差异大的时候，需要及时进行补开发票，或及时更改发票信息，以保证报账金额与实际报销金额的一致性。