一般纳税人捐赠公益1000元，可以扣除相应的个人所得税。根据《个人所得税法》第三十七条中规定，纳税人买卖成交，受让股票、债券，参加股权认购，实施人身保险业务的收入所得，以及对于债务的清偿，由当事人在办理个人所得税申报时，减去其应税收入的10%作为减免个人所得税处理。 另外，被验收及被批准的捐赠收入，收入者可以按照其实际捐赠收入的20%作为减免计算个人所得税，即纳税人捐赠1000元，可以减免200元的个人所得税。 拓展知识：纳税人捐赠公益，还包括捐赠义务教育；文化、科技事业等捐赠收入，应税收入的10％至20％可以作为减免的计算个人所得税。另外，纳税人捐赠收入，还可以按照规定计入捐赠费用，以减少企业所得税。