在现有的疫情居家条件下，公司分公司的员工是否可以使用总公司账户发放工资取决于分公司工资管理需求。一般来说，总公司可以在总部开设一个集中工资支付账户，不同分公司的员工分别能够从这个集中账户中支取自己的工资。如果分公司设有独立的工资管理体系，那么就可以采用总公司的账户，由分公司的部门经理直接扣发到员工个人账户中；反之，如果分公司没有设立独立的工资管理系统，那么分公司员工的工资就需要由总公司的账户直接发放，分公司员工可以从总公司的账户中收取自己的薪水。 总而言之，将工资发放到总公司账户可以确保资金安全，支付方便，但具体是否可行要根据实际情况和分公司的工资管理体系而定。此外，在居家期间，公司还可以采取一些技术措施来改善工资支付服务，提升员工满意度，比如采取完整的账户余额客户端，可以自助查询和交易账户信息，更方便的支付记录余额和积分的支付等。