如果发现公司进项税大于销项税，可能存在以下问题，需要仔细核查： 首先，可能有发票报销不当，发票报销不按规定，违反营改增改造政策，发票使用不当等； 其次，可能税种选择不当，根据财务部门的建议选择税种，有些产品的税种划分容易出错； 再次，可能存在销项税额抵扣不当，如有些进项发票原开票人已经抵扣，但是实际上可抵扣的税额没有抵扣，导致进项税大于销项税； 此外，可能存在进项税额修正不当，税务局抽查期间发现可以减少进项税额，但是企业没有及时作出相应修正，从而导致进项税大于销项税。 因此，做为企业财务人员，应该认真调查，尽快发现有关问题，并及时采取有效措施，以保证税收合规，否则将会面临相关税务处罚。 拓展知识：销售方义务报送出口监销系统中的有效普通发票及抵扣票，根据不同税收种类的规定，可以享受抵扣。具体到抵扣，根据税收种类的不同，可以分为增值税，消费税，营业税以及个人所得税等，抵扣要满足有效普通发票的差额与应纳税额一样且超过一定比例，才能够获得减税的优惠。