处理退税申报发生异常的方法如下： 1、确认准确信息：首先，企业应在开具发票时确认发票信息是否准确，核实准确后，就可以正常申报退税，若发现出现异常，需及时作出处理。 2、修改发票：若发现发票出现异常情况，可申请发票改正，若改正的发票可在已经发放的偏远地区电子发票查验系统上查验，才能有效。 3、申请再开票：若无法通过发票改正，就需要申请重新开票，根据国家开发票的有关形式，可重新开具发票并申请退税。 4、免税处理：对于确认发票信息异常无法修正的情况，可依据国家规定申请免税处理，但这种方式可能会降低企业的退税金额。 拓展知识： 关于退税申报，企业可以通过传统的电子税务局、税务事务所等方式进行申报；也可以通过新兴的大数据技术、云计算技术，使用在线税务平台完成退税申报，无须担心出现异常情况的发生。