跨年度的房屋租金应纳税所得额计算使用的是“比例法”。具体流程是：首先，将跨年度租金收入按每年收入分摊计算，确定税前收入；然后，根据当年累计收入，累计分摊税前收入，以比例计算每月应扣缴税额，累计月度税额至期末，实现跨年度房屋租金所得税的正确缴纳；最后，根据跨年度租金税前收入及应扣缴税额的累计，填制期末税款返还申请，按时上交完税凭证及本年度应纳税款额，以免追缴税款。 拓展知识：房屋租金所得税一般在租金收入当月收取，房屋租金所得税是按照“递延纳税”的原则，按月申报、缴纳的。在申报和缴纳税款时应该根据收入的实际情况，采用合适的方法，避免过高或过低的缴纳税款。