是的，在单位将专利转让给其他公司时，可以开具免税发票。免税发票，也称出口发票或增值税专用发票，是增值税征收中使用的独特票据，有利于出口企业申报退税。但开具发票前是需要先做备案的，备案手续一般是到税务局去办理，依据不同地区的不同政策，可能会要求提供营业执照、税务登记证、组织机构代码证等相关证明文件。备案完成后，税务机关会出具备案证明，只有拥有此证明方可开具免税发票。此外，在每张发票中还要额外注明转让专利信息，即被转让专利的名称、编号及转让日期，以便税务机关审计与查证。 拓展知识：税务机关审计给予的凭证重要性，企业需要注意准确填写发票，只有准确提供相关财务资料，税务机关才能完成审核，并给予退税。此外，税务凭证的保存期也非常重要，做税务凭证的保留期是一年，超过一年的凭证就不能办理退税，如果企业存有超过一年以上的凭证，需要尽快结算。