根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，个体工商户的个人所得税应由其收入的合计额中计算出。 首先，要计算个体工商户的个人所得税，需要确定其收入的合计额。它包括企业所得税、财产税、个人所得税以及其它收入。 其次，根据个体工商户的个人所得税规定，扣除财产税、企业所得税、和其它扣除项之后得出的净收入是纳税依据。 接下来，根据净收入的金额对应的税率，计算出应缴纳的个人所得税额。 最后，根据有关要求，完成填写《个人所得税专用发票》，并把所需凭证（如 工资单、收据等）和发票一并送至税务机关备案。 以上是个体工商户的个人所得税的计算过程。个体工商户如果要准确计算税款，应加强对税法的了解，遵守相关税收规定，积极配合当地税务机关，履行自己的税收义务。