通行费发票分为以下两种：一、左上角标志“通行费”字样，且税率栏次显示适用税率或征收率的通行费电子发票；二、左上角无“通行费”字样，且税率栏次显示“不征税”的通行费电子发票。只有在左上角标志“通行费”字样，且税率栏次显示适用税率或征收率的通行费电子发票才能够进行抵扣，纳税人在取得可抵扣的通行费电子发票后，只要根据发票上注明的税额抵扣就可以。