船舶吨税和车船税的最大区别在于船舶吨税是针对进出中国港口的国际航行船舶，车船税只针对国内的汽车和船舶，两者针对的对象不一样。 船舶吨税是海关代为对进出中国港口的国际航行船舶征收的一种税。其征收税款主要用于港口建设维护及海上干线公用航标的建设维护。 车船税是指对在我国境内应依法办理登记的车辆、船舶，根据其种类，按照规定的计税依据和年税额标准计算征收的一种财产税。从2007年7月1日开始，有车族需要在投保交强险时缴纳车船税。 船舶吨税：指自中华人民共和国境外港口进入境内港口的船舶的一种税，由海关征收。 车船税：指在中华人民共和国境内属于《中华人民共和国车船税法》所附《车船税税目税额表》规定的车辆、船舶的一种税，由税务部门征收