1、定义不同：结余资金是指结算后当年剩余的资金，是在当年预算工作目标已完成，或者因故终止，而造成的当年的剩余资金，一般指收入与支出相抵后的余额，即财政收入大于支出的部分；结转资金是指当年支出预算已执行但尚未完成，或因故未执行，在当期未使用完、下年需按原用途继续使用的财政拨款资金，也就是指在结算的时间段里，由于工作目标尚未达到而暂时没有使用完的资金，也可以说是结余中有专项用途、需继续安排使用的资金。 2、结算对象不同：结转资金是一个工作目标没有完成的结算结果；结余资金是支出预算的一个工作目标已完成或者因故终止的结算结果。 3、下年度使用的情况不同：结转资金是下一年度需要按照原用途继续使用的资金，结转资金原则上不得调整用途，将转入下一年按照原用途的预算继续使用；结余资金在下一年度不是按照原用途继续使用的资金，按预算管理的有关规定，一般是要收回国库，用于编制下年度的部门预算，统筹使用。 4、包含支出的内容不同：结转资金包括基本支出结转资金和项目支出结转资金；结余资金指项目支出结余资金，基本支出是没有结余资金的。