根据《中华人民共和国税收征收管理法》第三十条第三款的规定，税务机关按照规定付给扣缴义务人代扣、代收手续费。你公司代扣、代收个人所得税税款，所以税务机关按照《中华人民共和国税收征收管理法》退还你公司代扣、代收手续费。 同时根据《中华人民共和国个人所得税法》第十一条的规定对扣缴义务人按照所扣缴的税款，付给百分之二的手续费。