你好，和以前一样的做账，仍然是和公司的账目一起做账，但是设置一个独立项目，你可以把和这个项目有关的所有收入和支出独立设立明细账，为了清楚核算你也可以在银行单独开立一个普通银行账户将政府拨款和你们的投资都转入该账户，在你记账时只是这个银行也是你公司整体的一部分，做凭证时和原来一样只是在备注里标注这个项目的名称，在会计核算时为此项目设立一个明细账，记载该项目的全部收支。凭证不用单独做，只要有凭证号需要查找时也可以随时调阅。