企业自主向主管税务机关申报加计扣除，根据国税发〔2008〕116号文规定，企业在申报时应报送以下材料： 　　（1）自主、委托、合作研究开发项目计划书和研究开发费预算。 　　（2）自主、委托、合作研究开发专门机构或项目组的编制情况和专业人员名单。 　　（3）自主、委托、合作研究开发项目当年研究开发费用发生情况归集表。 　　（4）企业总经理办公会或董事会关于自主、委托、合作研究开发项目立项的决议文件。 　　（5）委托、合作研究开发项目的合同或协议。 　　（6）研究开发项目的效用情况说明、研究成果报告等资料