1、定义不一样：非独立核算是指没有完整的会计凭证和会计账簿体系，只记录部分经济业务的单位所进行的会计核算。独立核算则是对本单位的生产经营活动或预算执行过程及其结果进行全面的、系统的会计核算。 2、操作不一样：凡具有一定数额的资金，可对外办理结算，独立编制计划，单独计算盈亏的企业，一般都实行独立核算。实行非独立核算的单位本身没有资本，其财产物资由上级单位拨付，也没有独立的银行账户，其一切收入均存入上级单位账户，一切支出也由上级单位审核支付。 3、特点不一样：非独立核算单位的特点是一般由上级拔给一定数额的周转金，从事业务活动，一切收入全面上缴，所有支出向上级报销，本身不单独计算盈亏，只记录和计算几个主要指标，进行简易核算。