需要根据不同的情况区分，以下总结供您参考：

一、直接相关费用（不包含发行债券和权益性证券的手续费和佣金）

这里的直接相关费用是指为取得长期股权投资发生的手续费、交易费用等。

1.同一控制下的企业合并发生的直接相关费用计入当期损益（管理费用）；

2.非一同控制下的企业合并发生的直接相关费用计入当期损益（管理费用）

3.企业合并以外的其他方式下发生的直接相关费用(或者说是手续费等必要支出)计入投资成本。

（审计费、评估费和律师费等中介费用，合并计入管理费用，非合并计入长投成本）

二、发行债券和权益性证券作为合并对价的手续费、佣金的处理。（不区分非合并，同一还是非同一）

1.以发行债券方式进行的企业合并，与发行债券相关的佣金、手续费等，应计入负债的初始确认金额。

2.以发行权益性证券（股票）作为合并对价的，与所发行权益性证券相关的佣金、手续费等，不管其是否与企业合并直接相关，均应自所发行权益性证券的发行收入中扣减，在权益性工具发行有溢价的情况下，自溢价收入中扣除，在权益性证券发行无溢价或溢价不足以扣减的情况下，应当冲减盈余公积和未分配利润。