吉林省个税申报系统的电子申报流程如下：
1. 登录系统：首先，打开吉林省个税申报系统的官方网站，点击登录按钮进入系统。
2. 注册账号：如果是首次使用该系统，需要点击注册按钮进行账号注册。填写个人信息并设置登录密码。
3. 填写申报表：登录系统后，选择需要申报的税种，填写相应的申报表。根据个人情况填写收入、扣除项目等相关信息。
4. 核对信息：填写完毕后，系统会自动进行数据核对，确保填写的信息准确无误。如果有错误，系统会提示修改。
5. 提交申报：核对无误后，点击提交申报按钮，将申报表的数据发送给税务部门。
6. 缴纳税款：根据申报的数据，系统会自动计算应缴纳的税款金额。申报人可以选择在线支付或者去税务部门缴纳税款。
7. 确认申报：缴纳税款后，系统会生成申报确认函，申报人可以下载保存或者打印备份。

需要注意的是，个人申报个税时，要准备好个人身份证、银行卡等相关证件和信息，以便顺利完成申报流程。此外，吉林省个税申报系统的具体操作流程可能会根据系统更新而有所变化，建议在使用前先阅读系统提供的操作指南或咨询相关部门。