主营业务成本出现负数的原因可能有以下几个方面：
1. 错误的数据录入：可能是由于会计人员在录入数据时出现了错误，比如将收入误录为支出，或者将支出误录为收入。这种情况下，需要仔细检查数据录入的准确性，并及时进行更正。
2. 销售退货或退款：如果企业发生了销售退货或退款的情况，可能会导致主营业务成本出现负数。这是因为退货或退款会减少销售收入，同时也会减少与销售相关的成本。在这种情况下，需要根据具体的退货或退款情况进行调整。
3. 会计政策变更：企业在会计政策上发生变更，比如改变了成本核算方法或计算成本的依据，可能会导致主营业务成本出现负数。这种情况下，需要按照新的会计政策进行调整，并在财务报表中进行披露。
4. 销售成本计算错误：如果企业在计算销售成本时出现错误，比如将销售成本计算为负值，可能会导致主营业务成本出现负数。这种情况下，需要仔细检查销售成本的计算方法，并进行修正。

总之，主营业务成本出现负数可能是由于数据录入错误、销售退货或退款、会计政策变更或销售成本计算错误等原因所致。在发现这种情况时，会计人员应该及时进行调整和修正，确保财务报表的准确性和可靠性。