差额征税是一种税收制度，适用于某些特定行业或企业，其核心是以差额（即销售收入减去可抵扣费用）作为应纳税额的计算基础。差额征税的应交税费会计分录会对财务报表产生以下影响：
1. 资产负债表：应交税费会计分录的借方会增加应交税费的金额，从而增加负债项目中的应交税费。同时，贷方会减少应交税费的金额，从而减少负债项目中的应交税费。
2. 利润表：应交税费会计分录的借方会减少利润，从而降低净利润。这是因为应交税费是税前利润的一部分，减少应交税费会增加税前利润。同时，贷方会增加利润，从而增加税后利润。
3. 现金流量表：应交税费会计分录的借方会减少现金流入，从而减少经营活动现金流入的金额。同时，贷方会减少现金流出，从而减少经营活动现金流出的金额。

需要注意的是，差额征税的应交税费会计分录只是税务处理的一部分，实际上税务处理可能还涉及其他税收科目的会计分录。因此，在编制财务报表时，还需要综合考虑其他税收科目的影响。