商标注册费用应根据会计准则的规定进行计入财务报表。一般情况下，商标注册费用应被视为一项无形资产，并按照以下两种方法之一进行处理：
1.资本化方法：根据会计准则的规定，商标注册费用可以被资本化为商誉或无形资产，并在财务报表中以资产形式呈现。在资本化过程中，商标注册费用将被分摊到其预期使用寿命内，以反映其经济效益的消耗。
2.费用化方法：商标注册费用也可以选择直接费用化，即将其全额计入当期费用，作为财务报表中的费用项目进行呈现。这种方法适用于商标注册费用较低或者其预期使用寿命较短的情况。

无论选择哪种方法，都需要符合会计准则的要求，并在财务报表中进行充分的披露，以使读者能够理解和评估商标注册费用对企业财务状况和经营绩效的影响。