个体工商户的税率是根据营业额来确定的。根据《中华人民共和国个人所得税法》第七十六条规定，个体工商户的税率是根据不同的营业额档次来确定的。

根据最新的个人所得税法修订，个体工商户的税率如下：

- 营业额不超过30万元的，适用3%的税率；
- 营业额超过30万元至100万元的，适用5%的税率；
- 营业额超过100万元至300万元的，适用10%的税率；
- 营业额超过300万元至500万元的，适用20%的税率；
- 营业额超过500万元的，适用30%的税率。

根据你提供的信息，个体工商户的营业额为40万元，因此适用的税率是5%。