转让二手房增值税的计税依据主要是根据以下两个方面：
1. 房屋的成本：计税依据是房屋的成本，包括购房时支付的购房款、契税、公证费、中介费等直接与购房有关的费用。同时，还可以计入装修、维修、改建等与房屋增值有关的费用。
2. 房屋的增值额：计税依据是房屋的增值额，即转让价款减去购房时支付的费用和增值税的应税销售额。增值额需要根据相关规定进行计算，具体计算方法可以参考国家税务部门的相关规定。

需要注意的是，不同地区对于二手房的增值税政策可能有所不同，具体的计税依据和税率等细节可以根据当地的税务规定进行了解和操作。