小规模纳税人增值税附加税的计算方法如下：
1. 首先，确定纳税人的增值税销售额。增值税销售额是指纳税人在一定期间内实际销售货物、提供劳务的金额，不包括免税销售额和不征税销售额。
2. 然后，计算增值税销售额的附加税。小规模纳税人的增值税附加税率为5%，即增值税销售额乘以5%。
3. 最后，将计算出的增值税附加税加上增值税销售额，即得到纳税人需要缴纳的增值税总额。

需要注意的是，小规模纳税人的增值税附加税是按照销售额来计算的，而不是按照利润或净收入来计算的。此外，小规模纳税人的增值税附加税是固定的5%，不受销售额的大小或变化的影响。