当运输企业卖出车辆时，需要按照会计准则的规定来处理车辆出售的收入。具体处理方法如下：
1. 确定收入金额：根据销售合同或销售发票上的金额确定车辆出售的收入金额。
2. 确定销售成本：销售成本包括车辆的原值、累计折旧和减值准备等。
3. 计算销售利润：销售利润等于收入金额减去销售成本。
4. 记录会计凭证：根据会计准则的要求，按照双录原则记录会计凭证。一般情况下，会计凭证的借方应为银行存款或应收账款，贷方应为销售收入；借方应为销售成本，贷方应为库存现金或银行存款。
5. 更新资产负债表：根据销售凭证的借贷方向，更新资产负债表中相关的科目余额。
6. 更新利润表：将销售利润计入利润表中，以反映企业的经营业绩。

需要注意的是，以上处理方法仅供参考，具体操作还应根据企业的实际情况、会计准则的规定以及税务法规等因素进行具体分析和处理。建议在实际操作中，还应咨询会计师或税务专业人士的意见。