当增值税留抵退回时，应按照以下步骤调整会计科目的余额：
1. 增值税留抵退回是一种应收款项，因此应调整应收账款科目的余额。将原本的应收账款减少，反映增值税留抵退回的金额。
2. 同时，应调整应交税费科目的余额。将原本应交的增值税减少，反映增值税留抵退回的金额。
3. 如果增值税留抵退回的金额涉及到税金及附加科目，也需要相应调整税金及附加科目的余额。

需要注意的是，调整会计科目的余额时，应遵循会计准则和税法的规定，并确保准确记录和报告增值税留抵退回的金额。建议在调整会计科目余额前，咨询专业会计师或税务专家的意见。