是的，删除记账凭证的操作需要记录审计痕迹。审计痕迹是为了确保会计信息的准确性和可追溯性，以便审计人员或其他相关人员能够查找和验证删除操作的合法性和原因。

以下是记录审计痕迹的一些方法：
1. 记录删除操作的时间和操作人员：在删除记账凭证的操作中，记录下执行删除操作的具体时间和执行人员的姓名或标识。
2. 留下删除操作的原因：在删除操作的记录中，注明删除记账凭证的原因。例如，可能是由于输入错误、重复输入、系统错误等。
3. 保存删除前的原始凭证信息：在删除操作后，保留删除前的原始凭证信息的副本，以便审计人员或其他相关人员进行验证。
4. 记录删除操作的授权：如果删除操作需要授权才能执行，记录下授权人员的姓名或标识，并确保有授权的书面文件或电子记录。
5. 使用审计日志：在会计系统中，开启审计日志功能，记录所有的删除操作。审计日志应包括删除的凭证号码、删除的时间、删除的操作人员等信息。
6. 审计痕迹的备份和存档：确保所有的审计痕迹备份和存档，以便将来审计或其他需要时使用。

以上方法仅供参考，具体的记录审计痕迹的方式可以根据实际情况和公司的内部控制要求进行调整和完善。