物业水费差额征税是指物业公司在向业主收取水费时，将水费与税费分别列示并收取，然后将税费上缴国家财政部门。这种征税方式要求物业公司必须对税费进行核算和处理。

会计处理方法如下：
1. 在收取业主水费时，将税费单独列示并收取，将水费和税费分别计入收入账户和应交税费账户。
2. 在每个会计期间结束时，将应交税费账户中的税费转入税金及附加账户。
3. 在纳税时，将税金及附加账户中的税金上缴国家财政部门。
4. 如果物业公司无法确定税费的具体数额，可以按照一定比例估算税费，并将估算的税费计入应交税费账户。

需要注意的是，物业公司在进行会计处理时，应严格遵守税法和会计准则的规定，确保税费的准确核算和上缴。同时，物业公司应保留好相关的票据和凭证，以备税务部门的查验。