融资租赁设备折旧的计算方法与普通设备折旧有以下不同之处：
1. 所有权归属不同：融资租赁设备的所有权归属于租赁公司，而非企业本身，因此企业不能按照自己的资产进行折旧，而是要按照租赁合同约定的租赁期限进行折旧。
2. 折旧基数不同：普通设备的折旧基数是设备的原值，而融资租赁设备的折旧基数是租金支出，即企业每年支付的租金金额。
3. 折旧期限不同：普通设备的折旧期限通常按照国家规定的期限进行折旧，而融资租赁设备的折旧期限则根据租赁合同约定的租赁期限进行折旧。
4. 折旧方法不同：普通设备的折旧方法通常采用直线法、加速折旧法等，而融资租赁设备的折旧方法则通常采用等额本金法或等额本息法。

需要注意的是，融资租赁设备折旧的具体计算方法应根据租赁合同的约定和企业的实际情况进行确定。