受托加工企业的会计分录中，加工过程中的损耗应该按照以下方式进行处理：
1. 在原材料入库时，应该按照实际入库数量进行计价，并且应该将预计的损耗计入成本。
2. 在加工过程中发生的损耗应该按照实际损耗数量计价，并且应该将损耗的成本记入“制造费用”科目。
3. 在成品出库时，应该按照实际出库数量进行计价，并且应该将预计的损耗计入成本。
4. 在结算时，应该将实际损耗的成本从“制造费用”科目转移至“损失”科目。

综上所述，受托加工企业应该根据实际情况，合理计算和处理加工过程中的损耗，确保成本的准确计算和核算。