在合并比较报表中，被合并方的商誉应该按照以下方式处理：
1. 商誉的确认：被合并方的商誉应该在合并时被确认。商誉是指超过被合并方净资产的购买价格与净资产之间的差额。
2. 商誉的摊销：商誉应该在合并后的每个会计期间进行摊销。摊销的期限应该根据商誉的预期使用期限来确定。如果商誉的使用期限无法确定，则应该使用最长的期限，但不超过20年。
3. 商誉的减值：如果商誉的价值低于其账面价值，则应该进行减值测试。如果商誉的价值低于其账面价值，则应该对商誉进行减值。
4. 商誉的披露：在合并比较报表中，应该对商誉进行披露。披露应该包括商誉的金额、摊销期限、减值测试结果以及其他相关信息。

总之，在合并比较报表中，被合并方的商誉应该按照相关会计准则进行处理和披露。