市政工程会计核算中的主要科目包括：
1. 固定资产：包括土地、建筑物、机器设备等。
2. 工程施工：包括施工人工、材料、机械使用费用等。
3. 工程结算：包括工程款、工程结算尾款等。
4. 费用支出：包括工程管理费、物资采购费、运输费用等。
5. 收入：包括工程款、工程设计费等。
6. 税金及附加：包括土地增值税、城市维护建设税等。
7. 利润分配：包括税后利润分配、资本公积金等。

以上是市政工程会计核算中的主要科目，不同的企业可能会因为业务特点而有所不同，需要根据具体情况进行调整。